Analyse du génome et gestion des ressources génétiques forestières
Coll. Savoir faire

Les marqueurs génétiques sont largement utilisés pour estimer le polymorphisme et prédire l'évolution des populations végétales. L'avancée dans la connaissance du génome des plantes a favorisé le développement de marqueurs moléculaires ciblant une région de l'un des génomes nucléaire, chloroplastique et mitochondrial. Le développement de la génomique donne accès aux gènes contrôlant des caractères adaptatifs, très importants pour la gestion des ressources génétiques. Cet ouvrage est d'un intérêt plus général que celui des arbres forestiers ; il présente les principales méthodes d'analyse du génome, ainsi que la plupart des marqueurs moléculaires et leurs caractéristiques.

L'évaluation des ressources génétiques : l'analyse du polymorphisme. Conservation des ressources génétiques forestières. Classification des arbres forestiers. Organisation des génomes des arbres forestiers. Le génome nucléaire. Le génome chloroplastique. Le génome mitochondrial. L'évolution des génomes. Variabilité génétique des arbres forestiers. Ampleur de la variabilité. Évolution de la variabilité au cours des. générations. Flux de gènes. L'intérêt des marqueurs génétiques. Informations attendues des marqueurs. Paramètres décrivant la variabilité génétique. Relations entre marqueurs génétiques et caractères quantitatifs. Les outils d'analyse. Les marqueurs génétiques. Principes et généralités. Marqueurs morphologiques. Marqueurs biochimiques. Produits du métabolisme secondaire. Isoenzymes. Protéines totales. Marqueurs moléculaires. Mise en évidence du polymorphisme. Description des marqueurs moléculaires. Marqueurs moléculaires de séquences exprimées. Polymorphisme de nucléotide unique (SNP). Reproductibilité. Effet du prélèvement ou du tissu analysé. Difficultés techniques. Transfert entre laboratoires. Hérédité. Marqueurs du génome moléculaire. Marqueurs des génomes cytoplasmiques. Automatisation et analyses. Extraction et électrophorèse. Lectures de gels : analyse d'images. Puces à ADN. Programmes d'analyse de la diversité. Cytologie. Cytométrie. Cytophotométrie. Cytométrie en flux. Cytogénétique. Hybridation in situ (HIS). Hybridation de gènes (Fluorescent in situ hybridization, FISH). Hybridation de génome (Génome in situ hybridization, GISH). Applications et choix des marqueurs. Échantillonnage du génome. Transfert des marqueurs entre espèces. Adéquation marqueur - objectif. Critères de choix. Utilisations et choix des marqueurs. L'apport des marqueurs dans la gestion des ressources génétiques. Systématique et phylogénie. Histoire des populations. Introgression. Influence de grandes variations environnementales anciennes. Gestion des ressources génétiques. Évaluation des ressources génétiques. Gestion de réseaux de populations in situ. Ressources génétiques ex situ. Conclusions. Annexes. Références bibliographiques. Glossaire. Index.