La génomique en biologie végétale
Coll. Science update

Cet ouvrage illustre de façon claire et pédagogique les méthodes et les concepts qui sont à la base des progrès de la génomique en biologie végétale (grands programmes internationaux de séquençage, outils de la bio-informatique, méthodes d'analyse de l'expression des gènes incluant leurs produits métaboliques finaux et leur spécificité tissulaire et/ou cellulaire). Il rend compte des applications potentielles de la génomique dans les domaines de la génétique et de l'amélioration des plantes, de l'écophysiologie et de l'agronomie. Ce livre s'adresse aux étudiants de fin d'études universitaires ou agronomiques, aux professeurs de l'enseignement supérieur, aux techniciens, aux ingénieurs et scientifiques qui souhaitent acquérir des connaissances en génomique végétale.

Préface - Avant propos - Introduction - Génomique structurale et analyse in silico -1. Structure physique du génome nucléaire des plantes.- 2. Le séquençage de génomes de plantes - 3. Génomique et bio-informatique, introduction - 4. Banques et bases de données en biologie - 5. Prédiction de gènes - 6. Stratégies permettant d'assigner une fonction in silico aux séquences protéiques issues de projets de génomique - 7. Les comparaisons massives de séquences protéiques - Génomique fonctionnelle : de la séquence à la fonction in planta - 8. Les collections de mutants et la génétique inverse.- 9. Analyse du transcriptome végétal par les puces à ADN - 10. La protéomique et ses applications à la biologie végétale - 11. L'apport de la microscopie et de l'imagerie en génomique -12. Métabolome -13. Mesures de flux métaboliques - Les plantes modèles de la génomique végétale - 14. L'espèce modèle Arabidopsis thaliana -15 Le riz : une plante modèle pour la génomique végétale -16. Medicago truncatula, plante modèle pour les légumineuses et les interactions plantes-microorganismes - 17. La tomate, espèce modèle pour la génomique des Solanacées et l'ensemble des fruits charnus - Génomique, variabilité génétique et amélioration des plantes - 18. Les marqueurs moléculaires -19. Eléments transposables et analyse de la biodiversité végétale - 20. Génomique, caractérisation de gènes majeurs et de QTL - 21. Dissection génétique d'un caractère complexe chez Arabidopsis : lignées recombinantes et recherche de QTL - 22. Evolution moléculaire et validation de gènes candidats - 23. Le maïs et le blé, céréales modèles pour la recherche en biologie intégrative et son application à la sélection - Réflexions sur la génomique - 24. Combiner génomique et modélisation pour l'analyse de la tolérance aux contraintes environnementales - 25. De la génomique à l'auto-organisation -26. Protection et diffusion des résultats de génomique et biotechnologies végétales :quels enjeux pour la recherche publique ? - Glossaire - Index - Liste des auteurs